古籍
澳门公共图书馆现藏有古籍约四万册，收藏1950年以前的中西文古籍。中文及西文古籍分别藏于何东图书馆和议事亭藏书楼。何东图书馆的“何东藏书楼”现藏有二万多册中文古籍，其中以近代着名藏书家刘承干“嘉业堂”旧藏的十六种善本最重要。而在这十六种善本古籍中，以《翁方纲纂四库提要稿》最为珍贵。议事亭藏书楼现藏有二万多册西文古籍，收藏16世纪至20世纪葡萄牙在远东的歷史文献，前葡属各海外领地的法令文献等。
古籍推介
Defeza do Darwinismo: refutação dum artigo do Jornal “Catholic Register”是由两位葡萄牙人： Policarpo António da Costa (1837-1884) 和比厘喇马忌士医生 （Lourenço Maria Pereira Marques, 1852- 1911）合着的一本小书，他们各自撰写一篇文章支持达尔文的“物种起源论”。Policarpo António da Costa 曾在香港的Hong Kong Canton & Macao Steamboat Co. Ltd. 担任秘书，他亦获葡萄牙颁发Ordem Militar de Nossa Senhora da Conceição de Vila Viçosa勋章。马忌士医生幼时在澳门若瑟堂书院读书，1877年在爱尔兰都柏林医科毕业；1878年回港行医16年之久，曾先后在“香港国家医院”（Hospital Civil）、西营盘“香港性病医院”（Lock Hospital）担任院长。退休后回澳赠诊，并将其藏书赠给澳门国立图书馆（Biblioteca Nacional de Macau），现藏于议事亭藏书楼。本书是作者P. A. da Costa 赠送给庇山耶的赠书，后期庇氏将它转赠给图书馆，所以本书同时盖有P. A. da Costa和庇山耶的印章。
事缘于1880年6月10日为纪念葡国诗人贾梅士逝世300周年（现名为“葡国日、贾梅士日暨葡侨日”），位于香港中环雪厂街16号的葡人“西洋会”（Club Lusitano）举办了一个大型文化活动，当中有研讨会、诗词朗读等。所徵集得来的文稿和活动纪要都刊登在Memoria dos festejos celebrados em Hong Kong por ocasião do Tricentenario do prinicipe dos poetas portuguezes Luiz de Camões 一书中（书名意译：在港庆祝贾梅士300周年纪念特刊，此书现为本馆所藏)。在徵集得来的文稿之中，有马尼拉大学校长 Fonseca 神父，以“Un Admirador”为笔名，提交了一篇反对“物种起源论”的文章（83-85页）。鑑于其内容与“西洋会”的宗旨有异，特刊主编 P. A. da Costa对该文发表了一篇异议声明，并登于特刊的第94页。但Fonseca 神父所写的文章却曾在香港的“Catholic Register”获得认同及高度赞赏。1880年9月13日P. A. da Costa 去信“Catholic Register”表示不认同。10月16日P. A. da Costa接到“Catholic Register”语带攻击和挖苦的回应。这促使“西洋会”委派特刊主编P. A. da Costa和马忌士医生出版Defeza do Darwinismo，为“达尔文物种演化论” 作更详细深入的申辩，以解决这神学与科学之争。
P. A. da Costa 用了30 页去解释出版该书的来龙去脉，同时也引用多篇已发表和出版的科学论文，试图证明物种演化的观点。马忌士医生也用了51页的篇幅去说明他的看法。他认为不是他刻意去反对他尊重的传教士意见。马医生的人生哲学是相信“演化”这个概念。他所受的医学教育启发了他相信“演化”的概念。再经过他多年工作上的观察，时间的考验，使他深信“演化”的真实性。对他来说“逻辑推论”亦是“演化”的一种。马医生根据很多着作，从不同学科领域去证明达尔文的物种演化是通过自然选择（天择）的方式实现的。他逐一反驳“Catholic Register” 所载的观点，透过德国、法国的专家在地质学、胚胎学、解剖学等范筹的理论去解释人类的演化。马医生亦指出，以前“Catholic Register”也有刊登过“进化论”这类文章，所以他相信这些理论并不减少人们对天主的敬仰，也不否定天主教的伟大。
达尔文《物种起源》出版于1859年，该书是19世纪最具争议的着作之一。我们可以透过Defeza do Darwinismo: refutação dum artigo do Jornal “Catholic Register”了解土生葡人在当时的科学观，同时也可以明白到在亚洲一带的天主教团体相当保守，对某些科学观仍十分抗拒。